RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EURLQ9NYK6 297 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCM1Q15154 2024 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HEATR9A2RTY3 570 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SUN1O94901 812 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CD63P08962 238 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SOX8P57073 446 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMEM139Q8IV31 216 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HES6Q96HZ4 224 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RANBP9Q96S59 729 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IQCF5A8MTL0 148 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KDM1AO60341 852 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GPC4O75487 556 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CBX6O95503 412 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGHEP01854 428 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALPPP05187 535 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR4L1Q8NH43 312 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IL17FQ96PD4 163 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SEC16AO15027 2179 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ESPL1Q14674 2120 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A1B0GX78 115 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WIPF3A6NGB9 483 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AGPSO00116 658 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LIASO43766 372 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALOX12BO75342 701 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DDAH2O95865 285 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GAS8O95995 478 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CD9P21926 228 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALAS2P22557 587 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ADRA1DP25100 572 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CYP2A13Q16696 494 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FCRL6Q6DN72 434 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COX15Q7KZN9 410 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KRT222Q8N1A0 295 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FKBP10Q96AY3 582 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TTC1Q99614 292 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DESI2Q9BSY9 194 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CARD6Q9BX69 1037 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLCO2B1O94956 709 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CLDN1O95832 211 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ONECUT2O95948 504 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LDLRP01130 860 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IFNB1P01574 187 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ETS1P14921 441 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MMP11P24347 488 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MCM3P25205 808 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AOAHP28039 575 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 STIP1P31948 543 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FDFT1P37268 417 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GRIA3P42263 894 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KIF5AQ12840 1032 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 Q6ZS92 163 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CUZD1Q86UP6 607 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DLG3Q92796 817 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPSB2Q99619 263 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RBSNQ9H1K0 784 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms