RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TYMP	P19971	482 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPARD	Q03181	441 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM187	Q14656	261 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PHKG1	Q16816	387 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT39	Q6A163	491 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	OLFM1	Q99784	485 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	C22orf31	O95567	290 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ASCL1	P50553	236 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCR3	P51677	355 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALCAM	Q13740	583 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	P2RY6	Q15077	328 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	G2E3	Q7L622	706 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10H2	O60403	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NXPH2	O95156	264 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	IRF2	P14316	349 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYL6B	P14649	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCR10	P46092	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SP3	Q02447	781 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	WBP1	Q96G27	269 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAM20	O43506	726 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLRA3	O75311	464 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGM3	O95394	542 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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