RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CA14Q9ULX7 337 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 MANBAO00462 879 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NPC1O15118 1278 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 BAG2O95816 211 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 KRT6AP02538 564 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 KRT6BP04259 564 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 KRT6CP48668 564 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ERVK-8P63133 956 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 RETREG3Q86VR2 466 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 OR2L2Q8NH16 312 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 COL4A3Q01955 1670 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 E7ENX8 843 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 AP1G1O43747 822 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 VPS4BO75351 444 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SLC22A3O75751 556 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SLC6A12P48065 614 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 KCNK10P57789 538 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 HORMAD1Q86X24 394 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 HM13Q8TCT9 377 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NEIL2Q969S2 332 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 COX14Q96I36 57 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 PCNAP12004 261 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CD22P20273 847 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 GNPDA1P46926 289 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 DGKQP52824 942 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PSME3P61289 254 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 CDKL1Q00532 357 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CDC16Q13042 620 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CEACAM7Q14002 265 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DOC2AQ14183 400 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 IFNEQ86WN2 208 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 ATL1Q8WXF7 558 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FBXL8Q96CD0 374 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 SNX6Q9UNH7 406 aa8.18□□□□□ -1.1
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