RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMP2P13473 410 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMC3P17980 439 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 P2RY2P41231 377 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 MAPK9P45984 424 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGCS1Q01581 520 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF33BQ06732 778 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CNTN1Q12860 1018 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 NFYCQ13952 458 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 E2F2Q14209 437 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 GRM2Q14416 872 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 FXNQ16595 210 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf27AQ580R0 203 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SFT2D3Q587I9 215 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 LPCAT4Q643R3 524 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ANO7Q6IWH7 933 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PDSS2Q86YH6 399 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 OR56A3Q8NH54 315 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM159Q96B96 161 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 COX14Q96I36 57 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 FCRL1Q96LA6 429 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC138Q96M89 665 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ACPTQ9BZG2 426 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTR8Q9H981 624 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf109Q9NX04 203 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 AQP12BA6NM10 295 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 AP1G1O43747 822 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 UGDHO60701 494 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJA2O60884 412 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PDYNP01213 254 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 JUPP14923 745 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ACPPP15309 386 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PCSK2P16519 638 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PEX2P28328 305 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PDHA2P29803 388 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC7A1P30825 629 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 DRD3P35462 400 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CASP2P42575 452 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR1P46091 355 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PREPP48147 710 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 GSK3BP49841 420 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CCR3P51677 355 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 BNIP2Q12982 314 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 AGERQ15109 404 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CCSMST1Q4G0I0 132 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SGO1Q5FBB7 561 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ATAT1Q5SQI0 421 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 LIPJQ5W064 366 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 LCN8Q6JVE9 175 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 IRGCQ6NXR0 463 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A7Q6PXP3 512 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 AGTRAPQ6RW13 159 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PARM1Q6UWI2 310 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SUSD1Q6UWL2 747 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA24Q86W54 205 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF547Q8IVP9 402 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 YAF2Q8IY57 180 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXL6Q8N531 539 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 NUDT8Q8WV74 236 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ATL1Q8WXF7 558 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 PYCR2Q96C36 320 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 CMTM7Q96FZ5 175 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms