RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 RMI1Q9H9A7 625 aa6.27□□□□□ -1.41
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PRPF40A-210ENST00000489741 PDK2Q15119 407 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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