RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 CATSPER2Q96P56 530 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 AKTIPQ9H8T0 292 aa26.04■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 INVSQ9Y283 1065 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 CADM4Q8NFZ8 388 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 SPACA7Q96KW9 195 aa26.03■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 CAPN7Q9Y6W3 813 aa26.03■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 ALG11Q2TAA5 492 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 UAP1L1Q3KQV9 507 aa26.02■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-210ENST00000489475 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 CHSY3Q70JA7 882 aa26.02■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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HOXB3-210ENST00000489475 TBPL1P62380 186 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CTBSQ01459 385 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 GGTA1PQ4G0N0 100 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DEFB119Q8N690 84 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 L3MBTL4Q8NA19 623 aa26.01■■□□□ 1.75
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HOXB3-210ENST00000489475 ORAI3Q9BRQ5 295 aa26.01■■□□□ 1.75
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF385DQ9H6B1 395 aa26■■□□□ 1.75
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC22A2O15244 555 aa26■■□□□ 1.75
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HOXB3-210ENST00000489475 KRT6CP48668 564 aa26■■□□□ 1.75
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HOXB3-210ENST00000489475 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 KLF10Q13118 480 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP19Q14CB8 494 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CLCA4Q14CN2 919 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 KLHDC7BQ96G42 594 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC6A18Q96N87 628 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SGPP1Q9BX95 441 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CLGNO14967 610 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 TNFP01375 233 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 LBPP18428 481 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CCND1P24385 295 aa25.99■■□□□ 1.75
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