RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487860.1

CHST10-212, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

TSL 4

Gene CHST10, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10-212ENST00000487860 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.42□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 USP34Q70CQ2 3546 aa11.42□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 A0A1B0GTQ1 180 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 YY2O15391 372 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 YKT6O15498 198 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 DFNA5O60443 496 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 KATNA1O75449 491 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 FAM107AO95990 144 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 FGF4P08620 206 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 EPB42P16452 691 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 EPORP19235 508 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CCND1P24385 295 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PKLRP30613 574 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 GDF5P43026 501 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CCR10P46092 362 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 RAB28P51157 221 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 HK2P52789 917 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PKNOX1P55347 436 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 GRIK2Q13002 908 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PRKG2Q13237 762 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 NAE1Q13564 534 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 TCEA2Q15560 299 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CGB2Q6NT52 195 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 IL27RAQ6UWB1 636 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CUZD1Q86UP6 607 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ZNF781Q8N8C0 355 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 AGAP11Q8TF27 550 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 A0A0C4DFX4 3053 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 KNL1Q8NG31 2342 aa11.41□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PPP6CO00743 305 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 OR7A17O14581 309 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 NOBOXO60393 691 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 WDR47O94967 919 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ESRRBO95718 433 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ANXA6P08133 673 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 GIMD1P0DJR0 217 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 FASLGP48023 281 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 TBPL1P62380 186 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SH3BP2P78314 561 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 TRAF3Q13114 568 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 E2F2Q14209 437 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 KRT33BQ14525 404 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 HOMEZQ8IX15 550 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SLC25A45Q8N413 288 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 TEX9Q8N6V9 391 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PYCR2Q96C36 320 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PRRX2Q99811 253 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 NTMT1Q9BV86 223 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 IPPKQ9H8X2 491 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 UCK1Q9HA47 277 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ZNF225Q9UK10 706 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ICKQ9UPZ9 632 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CHST10-212ENST00000487860 PI4KAP42356 2102 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms