RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 EDIL3O43854 480 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 NKX2-2O95096 273 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 AMBPP02760 352 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPINB2P05120 415 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PAEPP09466 180 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ACADSP16219 412 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GM2AP17900 193 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GNAZP19086 355 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TIMP3P35625 211 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 FASLGP48023 281 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 MTTPP55157 894 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ARPC4P59998 168 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 HPCAP84074 193 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PLIN5Q00G26 463 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GUCY2DQ02846 1103 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GRIK2Q13002 908 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGA7Q13683 1181 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC6Q16204 474 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 INAQ16352 499 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 MYLK3Q32MK0 819 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ADALQ6DHV7 355 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 CDC73Q6P1J9 531 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 LONP2Q86WA8 852 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PEX5LQ8IYB4 626 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCKQ8N0W5 287 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 MREGQ8N565 214 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 STKLD1Q8NE28 680 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 OR52I2Q8NH67 350 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5R1Q8NH85 324 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TAAR8Q969N4 342 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 IFT74Q96LB3 600 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM68Q96MH6 324 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3GL1Q99961 368 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 SIKE1Q9BRV8 207 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 MIS12Q9H081 205 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB17Q9H0T7 212 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 SIL1Q9H173 461 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 EXOC1Q9NV70 894 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 SBNO1A3KN83 1393 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 JCADQ9P266 1359 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 DUOX2Q9NRD8 1548 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMYM6O95789 1325 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 AFF2P51816 1311 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 C19orf81C9J6K1 198 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 BIRC5O15392 142 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 BAIAP3O94812 1187 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GNA14O95837 355 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT14P02533 472 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT16P08779 473 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM106CPP0CH98 169 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 CALB2P22676 271 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 NFKBIAP25963 317 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TMOD1P28289 359 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXC9P31274 260 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 CASP14P31944 242 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 MSH2P43246 934 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF131P52739 623 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 COG7P83436 770 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 DMPKQ09013 629 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GAGE5Q13069 117 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 GAGE6Q13070 117 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 OLIG2Q13516 323 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 RCN1Q15293 331 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TOMM20Q15388 145 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 IFT20Q8IY31 132 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC43Q8N309 656 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms