RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 KCNC4Q03721 635 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 DGUOKQ16854 277 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 AAK1Q2M2I8 961 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SGO1Q5FBB7 561 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 DENND1CQ8IV53 801 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RBFAQ8N0V3 343 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NUDT8Q8WV74 236 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SGCDQ92629 289 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PYURFQ96I23 114 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ITCHQ96J02 903 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 APOL5Q9BWW9 433 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 A0A096LPI6 279 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MANBAO00462 879 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TAPBPO15533 448 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ARHGEF15O94989 841 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ANGPTL1O95841 491 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KRT6AP02538 564 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KRT6BP04259 564 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CYBAP13498 195 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PRKACGP22612 351 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 IGFBP5P24593 272 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KRT6CP48668 564 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 HUNKP57058 714 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 HMGCS1Q01581 520 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PIGFQ07326 219 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CDK5R2Q13319 367 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 C17orf99Q6UX52 265 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PLD4Q96BZ4 506 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 B3GALT6Q96L58 329 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NTMT1Q9BV86 223 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KCNH6Q9H252 994 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FANCFQ9NPI8 374 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MTRRQ9UBK8 725 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 H0Y626 953 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 H7C4K7 107 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PER2O15055 1255 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TRIM16O95361 564 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 UGT2B4P06133 528 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ALOX5P09917 674 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ITGB6P18564 788 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ITGALP20701 1170 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PCMT1P22061 227 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NR4A1P22736 598 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 HMGCLP35914 325 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RHOAP61586 193 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 DUSP4Q13115 394 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 AQP6Q13520 282 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KCNA10Q16322 511 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ADCK1Q86TW2 530 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ABI1Q8IZP0 508 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SVOPQ8N4V2 548 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TAMM41Q96BW9 452 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 APOL4Q9BPW4 351 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PARVBQ9HBI1 364 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GIN1Q9NXP7 522 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TMEM221A6NGB7 291 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 M0QX08 132 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 WNT9AO14904 365 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 XYLBO75191 536 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GABARAPO95166 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FTH1P02794 183 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PRPS2P11908 318 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms