RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469856.1

ABCC10-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 10, human

TSL 3

Gene ABCC10, Length 285 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC10-208	ENST00000469856	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	NME4	O00746	187 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	TSPAN6	O43657	245 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	MTX2	O75431	263 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	G6PD	P11413	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	C6	P13671	934 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	GJA4	P35212	333 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR1	P46091	355 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ERF	P50548	548 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CTSC	P53634	463 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	BLMH	Q13867	455 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	INPP5A	Q14642	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ZNF366	Q8N895	744 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	OR2T3	Q8NH03	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856		H0YJX3	145 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	FFAR3	O14843	346 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR42	O15529	346 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	AP1G1	O43747	822 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	KAT7	O95251	611 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	SOD1	P00441	154 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	APOD	P05090	189 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	IL6	P05231	212 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	HLA-E	P13747	358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	HSD3B1	P14060	373 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	JUP	P14923	745 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PSMC3	P17980	439 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	HSD3B2	P26439	372 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	IL12A	P29459	219 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	HSPA13	P48723	471 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CLCN2	P51788	898 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ENPP2	Q13822	863 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	FXN	Q16595	210 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	HID1	Q8IV36	788 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	OR56A3	Q8NH54	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	DPY30	Q9C005	99 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	VCX	Q9H320	206 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC10-208	ENST00000469856	ITM2B	Q9Y287	266 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms