RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 LY6EQ16553 131 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SYT16Q17RD7 645 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SPATA46Q5T0L3 261 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CACHD1Q5VU97 1274 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SFMBT2Q5VUG0 894 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TAF3Q5VWG9 929 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SLC30A9Q6PML9 568 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 Q6ZSA8 131 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 Q6ZVL8 140 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ANKS3Q6ZW76 656 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CYS1Q717R9 158 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TMUB2Q71RG4 321 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF767PQ75MW2 155 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ADCK1Q86TW2 530 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 WDR5BQ86VZ2 330 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 NAXDQ8IW45 347 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PQLC1Q8N2U9 271 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 C6orf223Q8N319 242 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SIRT6Q8N6T7 355 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 BANPQ8N9N5 519 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KLHDC9Q8NEP7 349 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 DDI1Q8WTU0 396 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PLAC4Q8WY50 150 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TADA1Q96BN2 335 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC127Q96BQ5 260 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF354BQ96LW1 612 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MYADMQ96S97 322 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MCHR1Q99705 422 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF577Q9BSK1 485 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SUCNR1Q9BXA5 334 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 NT5C1AQ9BXI3 368 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PANK2Q9BZ23 570 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MAGEH1Q9H213 219 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 BCO1Q9HAY6 547 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 IL1RL2Q9HB29 575 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 LANCL2Q9NS86 450 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ABCF3Q9NUQ8 709 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ADAM22Q9P0K1 906 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM181Q9P2C4 612 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 POLLQ9UGP5 575 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TUBE1Q9UJT0 475 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF180Q9UJW8 692 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KCND3Q9UK17 655 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ACSL5Q9ULC5 683 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 OGDHLQ9ULD0 1010 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MTMR6Q9Y217 621 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 COQ6Q9Y2Z9 468 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 METP08581 1390 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 A0A0G2JLW4 131 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1W2PPR1 153 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 GAGE12JA6NER3 117 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF233A6NK53 670 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MS4A18H0YCH9 400 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 GRM8O00222 908 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TEX33O43247 280 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 AKR1B10O60218 316 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SRGAP2O75044 1071 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PALMO75781 387 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 BAIAP3O94812 1187 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 VNN1O95497 513 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 OLFM2O95897 454 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TBX18O95935 607 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV2-8P01709 118 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 AMY1AP04745 511 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms