RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445706.5

PACSIN2-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2, human

TSL 5

Gene PACSIN2, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN2-208	ENST00000445706	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	ASB1	Q9Y576	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706		A0A1W2PQ72	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	KCNK1	O00180	336 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	PRRG2	O14669	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	PYGM	P11217	842 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	MCM3	P25205	808 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	CHRNB4	P30926	498 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPAM1	P38567	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	RAB28	P51157	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	FANCC	Q00597	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	GHDC	Q8N2G8	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PACSIN2-208	ENST00000445706	TTI1	O43156	1089 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	NDST3	O95803	873 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	HOXC12	P31275	282 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	KLK8	O60259	260 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	PDHA2	P29803	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	GBE1	Q04446	702 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	KRT81	Q14533	505 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	MIEF2	Q96C03	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	MED26	O95402	600 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PACSIN2-208	ENST00000445706	TPO	P07202	933 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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