RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 MAGEA2P43356 314 aa14.2□□□□□ -0.14
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PTPRU-204ENST00000428026 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.2□□□□□ -0.14
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PTPRU-204ENST00000428026 GPX6P59796 221 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
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PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.19□□□□□ -0.14
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PTPRU-204ENST00000428026 C5orf51A6NDU8 294 aa14.19□□□□□ -0.14
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PTPRU-204ENST00000428026 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRU-204ENST00000428026 MAGEA12P43365 314 aa14.19□□□□□ -0.14
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PTPRU-204ENST00000428026 TEAD4Q15561 434 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRU-204ENST00000428026 MOGQ16653 247 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRU-204ENST00000428026 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRU-204ENST00000428026 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.19□□□□□ -0.14
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