RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RASGRP1O95267 797 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ADH1AP07327 375 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RFKQ969G6 155 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC42Q9Y546 428 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ELNP15502 786 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 XKP51811 444 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BIRC7Q96CA5 298 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ACBD6Q9BR61 282 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HIPK3Q9H422 1215 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PTPRCAPQ14761 206 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TGFBIQ15582 683 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2L5Q8NG80 312 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.028e-7■■■■□ 22
PTGFRN-201ENST00000393203 FATE1Q969F0 183 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A4Q9H015 551 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DAPL1A0PJW8 107 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CLIC1O00299 241 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PER2O15055 1255 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DEFA5Q01523 94 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 EXO5Q9H790 373 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1B0GVM2 712 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC72A6NJI9 287 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 K7EPI3 171 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDH7O60245 1069 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ALAS2P22557 587 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TEAD4Q15561 434 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DCLK1O15075 740 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CH25HO95992 272 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SMPD1P17405 629 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR4C6Q8NH72 309 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ITPAQ9BY32 194 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MAGEH1Q9H213 219 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HOXD13P35453 343 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FCRL5Q96RD9 977 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF38Q9H0F5 515 aa14.93□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 M0R2N6 131 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AURKAO14965 403 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SOX14O95416 240 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GMPRP36959 345 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KLK6Q92876 244 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SH3D21A4FU49 640 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 H3BNH8 94 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PDPK1O15530 556 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 G6PDP11413 515 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FCGR1BQ92637 280 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SKA1Q96BD8 255 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GBAP04062 536 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 EPHX1P07099 455 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ARPC4P59998 168 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FIBCD1Q8N539 461 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PEBP4Q96S96 227 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RHCGQ9UBD6 479 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms