RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 BORCS5Q969J3 196 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PP18 115 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 IRGMA1A4Y4 181 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PSMD11O00231 422 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 C1QTNF8P60827 252 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TOMM20Q15388 145 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 OAZ3Q9UMX2 235 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 CLIC1O00299 241 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 G6PDP11413 515 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TAF13Q15543 124 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TOP1MTQ969P6 601 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 IFNGP01579 166 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 CDH3P22223 829 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 C2orf27AQ580R0 203 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 FSHRP23945 695 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ATP12AP54707 1039 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 FOXM1Q08050 763 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 GPR65Q8IYL9 337 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 IL12RB2Q99665 862 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 CREBZFQ9NS37 354 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 A0A0G2JN53 185 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PDLIM1O00151 329 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 SCN2BO60939 215 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 NR4A1P22736 598 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ITPKBP27987 946 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 BDKRB1P46663 353 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 SEMA3AQ14563 771 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 NDUFA9Q16795 377 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PYDC2Q56P42 97 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 RTP4Q96DX8 246 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 CD247P20963 164 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 RFC2P35250 354 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 DAG1Q14118 895 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ZNF778Q96MU6 729 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PKP2Q99959 881 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 PGLSO95336 258 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 MYL9P24844 172 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 NXPE1Q8N323 547 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 AP3S1Q92572 193 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.27■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PLK4O00444 970 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 OR1I1O60431 355 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 GADD45GO95257 159 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 HSD17B2P37059 387 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 AGTR2P50052 363 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ENGP17813 658 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PGGT1BP53609 377 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ALG11Q2TAA5 492 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PEX13Q92968 403 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PITPNM1O00562 1244 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 EBLN1P0CF75 366 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 GJA5P36382 358 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 CCR8P51685 355 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 TLR9Q9NR96 1032 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PRKD3O94806 890 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 CEP97Q8IW35 865 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms