RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7A17O14581 309 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FPGTO14772 594 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PIP5K1BO14986 540 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ULK1O75385 1050 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR47O94967 919 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN9O95484 217 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT6AP02538 564 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT6BP04259 564 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RPN2P04844 631 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN1P07384 714 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 COX4I1P13073 169 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KELP23276 732 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PDHA2P29803 388 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT6CP48668 564 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TPMTP51580 245 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXA1P55317 472 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 STX5Q13190 355 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SQLEQ14534 574 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NAA25Q14CX7 972 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF4Q15306 451 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPRE2Q15555 327 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX31Q8N9S9 440 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 APOOQ9BUR5 198 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LGR4Q9BXB1 951 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR8Q9H981 624 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KLC4Q9NSK0 619 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF225Q9UK10 706 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB1Q9Y576 335 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1A2Q9Y585 309 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC28A1O00337 649 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GSC2O15499 205 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6AP2O75787 350 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf105O95561 183 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PCSK2P16519 638 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRG2P18507 467 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3R1P27986 724 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR1BP28222 390 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OXTRP30559 389 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B2P37059 387 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP4BP51164 291 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ2P63252 427 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIK2Q13002 908 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NAE1Q13564 534 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FGL2Q14314 439 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HERC3Q15034 1050 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTA3Q16772 222 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 METRNLQ641Q3 311 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM198Q66K66 360 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT13Q7L8C5 426 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LONP2Q86WA8 852 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM69Q86WT6 500 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGB4Q8WW32 186 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CATSPER2Q96P56 530 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNA7Q96RP8 456 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RTKNQ9BST9 563 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NDE1Q9NXR1 346 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GULP1Q9UBP9 304 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT16Q9UBV4 365 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX6Q9UNH7 406 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms