RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 SGK2Q9HBY8 427 aa15.38■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.38■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SNTNA6NMZ2 147 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ACOX3O15254 700 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CENPAP49450 140 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 OLR1P78380 273 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ATAD3BQ5T9A4 648 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ARMC5Q96C12 935 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PHOX2BQ99453 314 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ING3Q9NXR8 418 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GABRDO14764 452 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ALDH1A1P00352 501 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GKP32189 559 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NFKB2Q00653 900 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 KIAA1191Q96A73 305 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HSPB11Q9Y547 144 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GJB3O75712 270 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 STSP08842 583 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NR2F1P10589 423 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PPP2R1BP30154 601 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 KCNC1P48547 511 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CLCA4Q14CN2 919 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ITPAQ9BY32 194 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NLNQ9BYT8 704 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CPQQ9Y646 472 aa15.37■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 A0A0G2JN53 185 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 STC1P52823 247 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZXDBP98169 803 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SNAPC1Q16533 368 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HECTD3Q5T447 861 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 LGI4Q8N135 537 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEM169Q96HH4 297 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PYURFQ96I23 114 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TEPSINQ96N21 525 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 BRD9Q9H8M2 597 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MAFKO60675 156 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CATP04040 527 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GPX3P22352 226 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ST8SIA6P61647 398 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TUSC3Q13454 348 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HKDC1Q2TB90 917 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 M0QX08 132 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 RPP38P78345 283 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GMLQ99445 158 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 VAPAQ9P0L0 249 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 RFPL2O75678 378 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SERPINA4P29622 427 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 C2orf80Q0P641 193 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ACOX1Q15067 660 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 LCN8Q6JVE9 175 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 USP43Q70EL4 1123 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SPATC1Q76KD6 591 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 OR8H3Q8N146 312 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZBTB2Q8N680 514 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 EQTNQ9NQ60 294 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CORINQ9Y5Q5 1042 aa15.36■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms