RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269980.6

BCKDHA-201, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1, alpha polypeptide, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHA, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHA-201ENST00000269980 NEDD8Q15843 81 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 FGD3Q5JSP0 725 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 NEK5Q6P3R8 708 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 GPR149Q86SP6 731 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 AADATQ8N5Z0 425 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 SLC32A1Q9H598 525 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.65□□□□□ -0.06
BCKDHA-201ENST00000269980 A0A1W2PPW3 197 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 G3V2T6 193 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CLDN9O95484 217 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CST1P01037 141 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 IL7RP16871 459 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 NSG1P42857 185 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GALK1P51570 392 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ZNF773Q6PK81 442 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 HTR3DQ70Z44 454 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 MICU2Q8IYU8 434 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 FIBINQ8TAL6 211 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 NETO1Q8TDF5 533 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 SCRN2Q96FV2 425 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 EGLN2Q96KS0 407 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ZBTB18Q99592 522 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ACTR8Q9H981 624 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.64□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 IGSF6O95976 241 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 HPRP00739 348 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CRHBPP24387 322 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 AOAHP28039 575 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GABRR2P28476 465 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 EPHB3P54753 998 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CLDN8P56748 225 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 IMPG1Q17R60 797 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ANKRD46Q86W74 232 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CPXM2Q8N436 756 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 RNF175Q8N4F7 328 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 PYCR2Q96C36 320 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ARL15Q9NXU5 204 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 FBXO10Q9UK96 956 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 INVSQ9Y283 1065 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CREG1O75629 220 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GSNP06396 782 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 RETP07949 1114 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ANXA5P08758 320 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 C1SP09871 688 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GJA1P17302 382 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 SDC1P18827 310 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 SERPINA4P29622 427 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 HLA-FP30511 346 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 MAPK8P45983 427 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 SLC6A12P48065 614 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ATG9BQ674R7 924 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 KLHL35Q6PF15 583 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 SPRED2Q7Z698 418 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 TMC8Q8IU68 726 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ULK4Q96C45 1275 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 APIPQ96GX9 242 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 VNN3Q9NY84 501 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 USE1Q9NZ43 259 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.63□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BCKDHA-201ENST00000269980 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms