RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 AGAP14A8MT82 685 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CLIC3O95833 236 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CSRP3P50461 194 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 UBXN2BQ14CS0 331 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 OXA1LQ15070 435 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FAM131CQ96AQ9 280 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CRLS1Q9UJA2 301 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 WNT9AO14904 365 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SBK3P0C264 359 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFV2P19404 249 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ACRV1P26436 265 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FZD5Q13467 585 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CAMK2BQ13554 666 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF460Q14592 562 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 GPR33Q49SQ1 333 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PPP4R4Q6NUP7 873 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CEP97Q8IW35 865 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FLCNQ8NFG4 579 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 DTD2Q96FN9 168 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SIPA1Q96FS4 1042 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SCYL1Q96KG9 808 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ST14Q9Y5Y6 855 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 A8MU76 341 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 C7P10643 843 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 GRIA3P42263 894 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R39P59534 338 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PSME3P61289 254 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SMUG1Q53HV7 270 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 HECTD2Q5U5R9 776 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 LIPMQ5VYY2 423 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ZYG11AQ6WRX3 759 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CERS6Q6ZMG9 384 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CXorf40AQ8TE69 158 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 GANCQ8TET4 914 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SHDQ96IW2 340 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ALPK1Q96QP1 1244 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ABCG8Q9H221 673 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RAD18Q9NS91 495 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TLK1Q9UKI8 766 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.84■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 KCNH1O95259 989 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 MYF6P23409 242 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A1P30825 629 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CDKN2DP55273 166 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 POU4F1Q01851 419 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC32Q14392 662 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 BTLAQ7Z6A9 289 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SPNS2Q8IVW8 549 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NXPE1Q8N323 547 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CBR4Q8N4T8 237 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 EFHD1Q9BUP0 239 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ADI1Q9BV57 179 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 BOCQ9BWV1 1114 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB26Q9HCK0 441 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CDYLQ9Y232 598 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa19.83■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 E7ENX8 843 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FMO4P31512 558 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 POLD2P49005 469 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MLLT10P55197 1068 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NME5P56597 212 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NRSN1Q8IZ57 195 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SYNPOQ8N3V7 929 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD4Q8WVF5 259 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CYGBQ8WWM9 190 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CD93Q9NPY3 652 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf42Q9NWW7 574 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MUTYHQ9UIF7 546 aa19.83■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM64BA6NI03 449 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FADS2P1A8MWK0 482 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN6O43657 245 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CLPXO76031 633 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GABRG2P18507 467 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PTGER3P43115 390 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ARPC4P59998 168 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RAB10P61026 200 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GAS6Q14393 721 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CYP2U1Q7Z449 544 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 UBALD2Q8IYN6 164 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TRAM1L1Q8N609 369 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 AP2M1Q96CW1 435 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CTRCQ99895 268 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MROQ9BYG7 248 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF385DQ9H6B1 395 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms