RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579310.5

SPATA33-209, Transcript of spermatogenesis associated 33, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SPATA33, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA33-209	ENST00000579310	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SPATA33-209	ENST00000579310	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SPATA33-209	ENST00000579310	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SPATA33-209	ENST00000579310	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SPATA33-209	ENST00000579310	LY75	O60449	1722 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SPATA33-209	ENST00000579310	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SPATA33-209	ENST00000579310	BAG6	P46379	1132 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	PLSCR1	O15162	318 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	TEF	Q10587	303 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	RREB1	Q92766	1687 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SPATA33-209	ENST00000579310	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	PROM2	Q8N271	834 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	SLC39A6	Q13433	755 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
SPATA33-209	ENST00000579310	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	TXNRD1	Q16881	649 aa		33	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	CCDC27	Q2M243	656 aa		33	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		33	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	KCNQ3	O43525	872 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	KCNQ4	P56696	695 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SPATA33-209	ENST00000579310	C5	P01031	1676 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	SIK1	P57059	783 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	TJP1	Q07157	1748 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
SPATA33-209	ENST00000579310	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	ITPK1	Q13572	414 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	CHL1	O00533	1208 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SPATA33-209	ENST00000579310	GNAI1	P63096	354 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	IL16	Q14005	1332 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.79	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.76	■■■□□ 2.84
SPATA33-209	ENST00000579310	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SPATA33-209	ENST00000579310	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.7	■■■□□ 2.82
SPATA33-209	ENST00000579310	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SPATA33-209	ENST00000579310	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.69	■■■□□ 2.82

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