RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561610.1

PPP4C-202, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-202ENST00000561610 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-202ENST00000561610 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-202ENST00000561610 TEFQ10587 303 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 NEUROD2Q15784 382 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 NFE2L2Q16236 605 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 RUNDC1Q96C34 613 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 PALLDQ8WX93 1383 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 MCM10Q7L590 875 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 KCNQ4P56696 695 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 DCTN1Q14203 1278 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 CHD4Q14839 1912 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 UTRNP46939 3433 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 RIPK4P57078 832 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 IL17REQ8NFR9 667 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-202ENST00000561610 PROM2Q8N271 834 aa24.58■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 ATG3Q9NT62 314 aa24.58■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.58■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 PTGER2P43116 358 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 SYT17Q9BSW7 474 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 STK32BQ9NY57 414 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 LY75O60449 1722 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 SLC39A6Q13433 755 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 APAF1O14727 1248 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 ATP6V1AP38606 617 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 SIK1P57059 783 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-202ENST00000561610 MRC1P22897 1456 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-202ENST00000561610 BTBD11A6QL63 1104 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-202ENST00000561610 MIER1Q8N108 512 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-202ENST00000561610 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-202ENST00000561610 CCER2I3L3R5 266 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-202ENST00000561610 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-202ENST00000561610 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 SLC15A2Q16348 729 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 GPR162Q16538 588 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 MTFR1LQ9H019 292 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 C5P01031 1676 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF790Q6PG37 636 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 AK7Q96M32 723 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF827Q17R98 1081 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 PAPPAQ13219 1627 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 ITPK1Q13572 414 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 MSH5O43196 834 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 KCNQ3O43525 872 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 KLHL34Q8N239 644 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 ARXQ96QS3 562 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 AKT1S1Q96B36 256 aa24.39■■□□□ 1.5
PPP4C-202ENST00000561610 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 C4BP0C0L5 1744 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 PHF14O94880 888 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 GNPATO15228 680 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 TJP1Q07157 1748 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP4C-202ENST00000561610 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.33■■□□□ 1.48
PPP4C-202ENST00000561610 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-202ENST00000561610 STARD3NLO95772 234 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-202ENST00000561610 SMIM5Q71RC9 77 aa24.32■■□□□ 1.48
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