RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 RASSF7Q02833 373 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 CDK15Q96Q40 435 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.4□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 NCOA1Q15788 1441 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 BMP2P12643 396 aa8.39□□□□□ -1.07
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PRPF39-211ENST00000556782 NR5A1Q13285 461 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 MTMR2Q13614 643 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 PZPP20742 1482 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 ABCC5O15440 1437 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 FBXO41Q8TF61 875 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 ITPKCQ96DU7 683 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 PTPRTO14522 1441 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 DAPK1P53355 1430 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 ABCC3O15438 1527 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 PLA2R1Q13018 1463 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 KIF15Q9NS87 1388 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 SPTLC1O15269 473 aa8.36□□□□□ -1.07
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PRPF39-211ENST00000556782 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 ERBINQ96RT1 1412 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 TNRQ92752 1358 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 LYPD8Q6UX82 237 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 NR3C2P08235 984 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 AGERQ15109 404 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF39-211ENST00000556782 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 NLRP1Q9C000 1473 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 DEPDC5O75140 1603 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 CEP152O94986 1710 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 GRM5P41594 1212 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 KRT76Q01546 638 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.33□□□□□ -1.08
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PRPF39-211ENST00000556782 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 ADGRL2O95490 1459 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 ERVK-7P63135 1459 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 GJA5P36382 358 aa8.32□□□□□ -1.08
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PRPF39-211ENST00000556782 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.32□□□□□ -1.08
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PRPF39-211ENST00000556782 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.31□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.31□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 MAP10Q9P2G4 905 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.29□□□□□ -1.08
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PRPF39-211ENST00000556782 SVOPQ8N4V2 548 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 AK7Q96M32 723 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 KANK1Q14678 1352 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 IGHA1P01876 353 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 PTSQ03393 145 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRPF39-211ENST00000556782 TTLL8A6PVC2 850 aa8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 CFAP99D6REC4 459 aa8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 SLC24A1O60721 1099 aa8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRPF39-211ENST00000556782 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.27□□□□□ -1.09
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