RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555700.1

PAPLN-209, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 4,668 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-209ENST00000555700 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.96□□□□□ -0.01
PAPLN-209ENST00000555700 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PAPLN-209ENST00000555700 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.96□□□□□ -0.01
PAPLN-209ENST00000555700 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.96□□□□□ -0.01
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 MEIS3Q99687 375 aa14.96□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ARID3AQ99856 593 aa14.96□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.96□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.96□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.96□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TTC22Q5TAA0 569 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 VPS53Q5VIR6 699 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TNNQ9UQP3 1299 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 STK3Q13188 491 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.95□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.94□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.94□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.94□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.94□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TRPM2O94759 1503 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TPM2P07951 284 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TSPYL6Q8N831 410 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 C8orf34Q49A92 452 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.93□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 STK38Q15208 465 aa14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 SMC5Q8IY18 1101 aa14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 FBXW7Q969H0 707 aa14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 A0A087WZG4 1122 aa14.92□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 RAD21O60216 631 aa14.91□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.91□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 JMYQ8N9B5 988 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 EYA1Q99502 592 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 KCNA6P17658 529 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 ANXA1P04083 346 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC192P0DO97 292 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 TRIM5Q9C035 493 aa14.9□□□□□ -0.02
PAPLN-209ENST00000555700 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 IL13P35225 146 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 METTL24Q5JXM2 366 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 OLFM4Q6UX06 510 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 PREX2Q70Z35 1606 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 ZNF592Q92610 1267 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 EVI5LQ96CN4 794 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 KDM5CP41229 1560 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 SDSP20132 328 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.89□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 DCTPP1Q9H773 170 aa14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 CFAP45Q9UL16 551 aa14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 PDE1AP54750 535 aa14.88□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 ALDH1L1O75891 902 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 ATP2B1P20020 1258 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 ATP8B2P98198 1209 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 CHRNA2Q15822 529 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 HOMER1Q86YM7 354 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PAPLN-209ENST00000555700 TNMDQ9H2S6 317 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms