RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 ZMYND15Q9H091 742 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 KCNQ4P56696 695 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 APAF1O14727 1248 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 MCM10Q7L590 875 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 SPON1Q9HCB6 807 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB7AO95365 584 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 SLC39A6Q13433 755 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 ADGRB2O60241 1585 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 PHKG2P15735 406 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 GPR162Q16538 588 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 DCTN1Q14203 1278 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 MSL1Q68DK7 614 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 ATRNO75882 1429 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 WDR70Q9NW82 654 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-206ENST00000548122 NFE2L2Q16236 605 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 G3V3G9 751 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 IL13P35225 146 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SIK1P57059 783 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RGS12O14924 1447 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 MYL6BP14649 208 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 GNAI1P63096 354 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 A0A087WZG4 1122 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA2Q08379 1002 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SLIT2O94813 1529 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 USP32Q8NFA0 1604 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 PALLDQ8WX93 1383 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 CYP27B1O15528 508 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 NEXNQ0ZGT2 675 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K5Q99683 1374 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 PIGBQ92521 554 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 LGR6Q9HBX8 967 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SLC15A2Q16348 729 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 FBXW7Q969H0 707 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 SETDB2Q96T68 719 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 PLSCR1O15162 318 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms