RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 ERVV-2B6SEH9 535 aa22■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 LGR6Q9HBX8 967 aa22■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 LRRC4BQ9NT99 713 aa22■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 TMOD3Q9NYL9 352 aa22■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 PALLDQ8WX93 1383 aa21.99■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.99■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 ANP32CO43423 234 aa21.98■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 CEP350Q5VT06 3117 aa21.97■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 KCNQ4P56696 695 aa21.96■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.96■■□□□ 1.11
HACE1-211ENST00000521962 ZNF827Q17R98 1081 aa21.95■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 ATG3Q9NT62 314 aa21.95■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.95■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.94■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 CABP4P57796 275 aa21.94■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 IL17REQ8NFR9 667 aa21.94■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.94■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.94■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.93■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.93■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.93■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 ARXQ96QS3 562 aa21.92■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 C5P01031 1676 aa21.91■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.9■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 AKT1S1Q96B36 256 aa21.9■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.9■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.9■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.89■■□□□ 1.1
HACE1-211ENST00000521962 NFE2L2Q16236 605 aa21.89■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.89■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.89■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.88■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 SIK1P57059 783 aa21.88■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 DCTN1Q14203 1278 aa21.88■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 MCM10Q7L590 875 aa21.88■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.88■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 MRS2Q9HD23 443 aa21.87■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.87■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 ITPK1Q13572 414 aa21.86■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 C4BP0C0L5 1744 aa21.86■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 TJP1Q07157 1748 aa21.86■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 NEFMP07197 916 aa21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 SLC39A6Q13433 755 aa21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 RUNDC1Q96C34 613 aa21.85■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.84■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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HACE1-211ENST00000521962 TEFQ10587 303 aa21.83■■□□□ 1.09
HACE1-211ENST00000521962 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 ATP6V1AP38606 617 aa21.81■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.8■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 RIPK4P57078 832 aa21.79■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 C1QTNF8P60827 252 aa21.79■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 KCNQ3O43525 872 aa21.78■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 ZNF790Q6PG37 636 aa21.78■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.77■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.77■■□□□ 1.08
HACE1-211ENST00000521962 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.76■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 BTBD11A6QL63 1104 aa21.76■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 APAF1O14727 1248 aa21.75■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 POLD1P28340 1107 aa21.75■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 NEUROD2Q15784 382 aa21.75■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 GPR162Q16538 588 aa21.75■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.75■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 SMIM5Q71RC9 77 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.74■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 AK7Q96M32 723 aa21.73■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.73■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.72■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.71■■□□□ 1.07
HACE1-211ENST00000521962 GNPATO15228 680 aa21.7■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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