RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PDE4D-223	ENST00000515011	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PDE4D-223	ENST00000515011	FLII	Q13045	1269 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PDE4D-223	ENST00000515011	MEIS3	Q99687	375 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PDE4D-223	ENST00000515011	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011		F6X3S4	739 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	CEP85	Q6P2H3	762 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	DCTPP1	Q9H773	170 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	HOXB7	P09629	217 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	TEF	Q10587	303 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PDE4D-223	ENST00000515011	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	CPD	O75976	1380 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	KCNQ3	O43525	872 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC4A3	P48751	1232 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	HMMR	O75330	724 aa		28.51	■■■□□ 2.16
PDE4D-223	ENST00000515011	GNAI2	P04899	355 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	GNAI3	P08754	354 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	MEGF6	O75095	1541 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.48	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	NBR1	Q14596	966 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PDE4D-223	ENST00000515011	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	BECN1	Q14457	450 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	PHKG2	P15735	406 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	USP44	Q9H0E7	712 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	MRC1	P22897	1456 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	TTC22	Q5TAA0	569 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PDE4D-223	ENST00000515011	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	ADCY9	O60503	1353 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	CDC45	O75419	566 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	ANXA1	P04083	346 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	APBB1	O00213	710 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PDE4D-223	ENST00000515011	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.33	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	C5	P01031	1676 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	CYP27B1	O15528	508 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PDE4D-223	ENST00000515011	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.31	■■■□□ 2.12

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