RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 MAP3K5Q99683 1374 aa11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 NFE2L2Q16236 605 aa11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 KLHL34Q8N239 644 aa11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 STK32BQ9NY57 414 aa11.79□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.78□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 TXNRD1Q16881 649 aa11.78□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.78□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 SLC15A2Q16348 729 aa11.77□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.77□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 GPR162Q16538 588 aa11.76□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.76□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.76□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 RIPK4P57078 832 aa11.75□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC27Q2M243 656 aa11.75□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 ARXQ96QS3 562 aa11.75□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.75□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 MTFR1LQ9H019 292 aa11.75□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 APAF1O14727 1248 aa11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 MRC1P22897 1456 aa11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa11.74□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 CABP4P57796 275 aa11.73□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 TEFQ10587 303 aa11.73□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.73□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.73□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.73□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 IL17REQ8NFR9 667 aa11.72□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.72□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 NHSQ6T4R5 1651 aa11.71□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 CEP350Q5VT06 3117 aa11.71□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SORCS1-208ENST00000486192 NEUROD2Q15784 382 aa11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF827Q17R98 1081 aa11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 MCM10Q7L590 875 aa11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 PIGBQ92521 554 aa11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 LGR6Q9HBX8 967 aa11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.69□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.69□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 IL16Q14005 1332 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 BTAF1O14981 1849 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 KCNQ4P56696 695 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 WDR63Q8IWG1 891 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 WWC1Q8IX03 1113 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.68□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 BTBD11A6QL63 1104 aa11.67□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 DCTN1Q14203 1278 aa11.67□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.67□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.67□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.67□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 PALLDQ8WX93 1383 aa11.67□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 GNAI1P63096 354 aa11.66□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF790Q6PG37 636 aa11.66□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 CFAP44Q96MT7 982 aa11.66□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 IFT57Q9NWB7 429 aa11.66□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF521Q96K83 1311 aa11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 PAPPAQ13219 1627 aa11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 ATG3Q9NT62 314 aa11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-208ENST00000486192 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.65□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 CHL1O00533 1208 aa11.64□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.64□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.64□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF853P0CG23 659 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 SIK1P57059 783 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.63□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 POLD1P28340 1107 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 GOLGA2Q08379 1002 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 ITGB4P16144 1822 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms