RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG5O94827 1062 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 PDE4AP27815 886 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 DCTN1Q14203 1278 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 ABTB2Q8N961 1025 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRC-210ENST00000462363 C14orf37Q86TY3 774 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRC-210ENST00000462363 NUCB1Q02818 461 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRC-210ENST00000462363 G2E3Q7L622 706 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.16□□□□□ -1.26
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