RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 PRR7Q8TB68 274 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-204ENST00000461018 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 KIF3BO15066 747 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 YY1P25490 414 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 TSC1Q92574 1164 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 NLRP1Q9C000 1473 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 NCOA2Q15596 1464 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 ALDH1A1P00352 501 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 KCNA6P17658 529 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 C8orf37Q96NL8 207 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SPTLC1O15269 473 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 LRP5O75197 1615 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 HRCP23327 699 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SKOR1P84550 965 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SHPRHQ149N8 1683 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.24□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 EP400Q96L91 3159 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 H3BM21 787 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 FAM117AQ9C073 453 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CLIP1P30622 1438 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 DIP2AQ14689 1571 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.23□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 MSH6P52701 1360 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CFAP99D6REC4 459 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 CTHP32929 405 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 GJA5P36382 358 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 QPCTQ16769 361 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 TIAM1Q13009 1591 aa7.21□□□□□ -1.25
CNN3-204ENST00000461018 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 ADAMTS2O95450 1211 aa7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 BMP1P13497 986 aa7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 VEGFBP49765 207 aa7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.21□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 NEUROD2Q15784 382 aa7.2□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 PTPRNQ16849 979 aa7.2□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.2□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.2□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 ERVK-7P63135 1459 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 SLIT1O75093 1534 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 SIAH2O43255 324 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 LINC01559Q495D7 138 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 BRINP3Q76B58 766 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 NGLY1Q96IV0 654 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 ERBB4Q15303 1308 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 TET3O43151 1660 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 KCNH2Q12809 1159 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 CCDC125Q86Z20 511 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 EID1Q9Y6B2 187 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 LILRB3O75022 631 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 DESI1Q6ICB0 168 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 LYPD8Q6UX82 237 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 BAP1Q92560 729 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-204ENST00000461018 USP21Q9UK80 565 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms