RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442011.6

TGFBI-201, Transcript of transforming growth factor beta induced, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGFBI, Length 2,804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBI-201ENST00000442011 PRAM1Q96QH2 718 aa14.96□□□□□ -0.01
TGFBI-201ENST00000442011 PPLO60437 1756 aa14.96□□□□□ -0.01
TGFBI-201ENST00000442011 HMMRO75330 724 aa14.95□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.95□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 UBE2HP62256 183 aa14.95□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 NPATQ14207 1427 aa14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 PTGS1P23219 599 aa14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 TCHHQ07283 1943 aa14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 RGS12O14924 1447 aa14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 CHMLP26374 656 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 ZFYVE9O95405 1425 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 ANAPC15P60006 121 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.93□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 F6X3S4 739 aa14.92□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 ZBTB22O15209 634 aa14.92□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 FEZ1Q99689 392 aa14.92□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 OGFRQ9NZT2 677 aa14.92□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 CDK19Q9BWU1 502 aa14.92□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 STX6O43752 255 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 IL13P35225 146 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 DRC7Q8IY82 874 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 SLC4A2P04920 1241 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 TPM3P06753 285 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 SYT1P21579 422 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 IL25Q9H293 177 aa14.91□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 LRMPQ12912 555 aa14.9□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TGFBI-201ENST00000442011 F13A1P00488 732 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 ABCC3O15438 1527 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 MCM10Q7L590 875 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.89□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC192P0DO97 292 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CAMK4Q16566 473 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 ZNF592Q92610 1267 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 LUZP1Q86V48 1076 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 VGLL3A8MV65 326 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 TNNT1P13805 278 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 TMEM51Q9NW97 253 aa14.88□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CHD1O14646 1710 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 AK2P54819 239 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 TAF3Q5VWG9 929 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CPA1P15085 419 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 G2E3Q7L622 706 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 PTPRCP08575 1304 aa14.87□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 NME9Q86XW9 330 aa14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 SMTNL1A8MU46 457 aa14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 HSPA4P34932 840 aa14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 GNAI2P04899 355 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 RUFY3Q7L099 469 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.85□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.84□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 PDE4CQ08493 712 aa14.84□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.84□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 TRIM5Q9C035 493 aa14.84□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 11.1
TGFBI-201ENST00000442011 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TGFBI-201ENST00000442011 LARGE1O95461 756 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms