RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
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PKDCC-202ENST00000401498 FAM9BQ8IZU0 186 aa39.74■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 RIPK4P57078 832 aa39.73■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 LY75O60449 1722 aa39.72■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 ASAP1Q9ULH1 1129 aa39.72■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 RREB1Q92766 1687 aa39.72■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 APAF1O14727 1248 aa39.7■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 ATG3Q9NT62 314 aa39.7■■■■□ 3.95
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PKDCC-202ENST00000401498 PALLDQ8WX93 1383 aa39.68■■■■□ 3.94
PKDCC-202ENST00000401498 TEFQ10587 303 aa39.67■■■■□ 3.94
PKDCC-202ENST00000401498 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
PKDCC-202ENST00000401498 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.65■■■■□ 3.94
PKDCC-202ENST00000401498 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.94
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PKDCC-202ENST00000401498 LRRC4BQ9NT99 713 aa39.62■■■■□ 3.93
PKDCC-202ENST00000401498 PAPPAQ13219 1627 aa39.62■■■■□ 3.93
PKDCC-202ENST00000401498 KCNQ4P56696 695 aa39.59■■■■□ 3.93
PKDCC-202ENST00000401498 LMOD3Q0VAK6 560 aa39.59■■■■□ 3.93
PKDCC-202ENST00000401498 SLC39A6Q13433 755 aa39.59■■■■□ 3.93
PKDCC-202ENST00000401498 SLC27A3Q5K4L6 730 aa39.59■■■■□ 3.93
PKDCC-202ENST00000401498 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa39.58■■■■□ 3.93
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PKDCC-202ENST00000401498 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa39.55■■■■□ 3.92
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PKDCC-202ENST00000401498 SLC4A9Q96Q91 983 aa39.53■■■■□ 3.92
PKDCC-202ENST00000401498 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
PKDCC-202ENST00000401498 UBR2Q8IWV8 1755 aa39.52■■■■□ 3.92
PKDCC-202ENST00000401498 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
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PKDCC-202ENST00000401498 TAF1LQ8IZX4 1826 aa39.51■■■■□ 3.92
PKDCC-202ENST00000401498 KCPQ6ZWJ8 1503 aa39.5■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF831Q5JPB2 1677 aa39.49■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 KCNQ3O43525 872 aa39.48■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 MIS18AQ9NYP9 233 aa39.48■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 C5P01031 1676 aa39.47■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 ATP6V1AP38606 617 aa39.47■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 TTC5Q8N0Z6 440 aa39.47■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 ITPK1Q13572 414 aa39.46■■■■□ 3.91
PKDCC-202ENST00000401498 KDM3BQ7LBC6 1761 aa39.44■■■■□ 3.9
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PKDCC-202ENST00000401498 CCDC27Q2M243 656 aa39.43■■■■□ 3.9
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF14Q5TI25 921 aa39.43■■■■□ 3.9
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
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PKDCC-202ENST00000401498 LINC00116Q8NCU8 138 aa39.4■■■■□ 3.9
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PKDCC-202ENST00000401498 ZNF827Q17R98 1081 aa39.39■■■■□ 3.9
PKDCC-202ENST00000401498 WWC1Q8IX03 1113 aa39.39■■■■□ 3.9
PKDCC-202ENST00000401498 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
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PKDCC-202ENST00000401498 VSIG10Q8N0Z9 540 aa39.37■■■■□ 3.89
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PKDCC-202ENST00000401498 BABAM1Q9NWV8 329 aa39.36■■■■□ 3.89
PKDCC-202ENST00000401498 TSPYL4Q9UJ04 414 aa39.36■■■■□ 3.89
PKDCC-202ENST00000401498 HEG1Q9ULI3 1381 aa39.36■■■■□ 3.89
PKDCC-202ENST00000401498 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
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PKDCC-202ENST00000401498 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJC10Q8IXB1 793 aa39.34■■■■□ 3.89
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PKDCC-202ENST00000401498 CFAP44Q96MT7 982 aa39.33■■■■□ 3.89
PKDCC-202ENST00000401498 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.88
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF853P0CG23 659 aa39.31■■■■□ 3.88
PKDCC-202ENST00000401498 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa39.31■■■■□ 3.88
PKDCC-202ENST00000401498 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PKDCC-202ENST00000401498 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
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PKDCC-202ENST00000401498 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa39.26■■■■□ 3.88
PKDCC-202ENST00000401498 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
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PKDCC-202ENST00000401498 UBR3Q6ZT12 1888 aa39.25■■■■□ 3.87
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PKDCC-202ENST00000401498 AK7Q96M32 723 aa39.25■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa39.25■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 QSER1Q2KHR3 1735 aa39.25■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 MBIPQ9NS73 344 aa39.25■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 CRKLP46109 303 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
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PKDCC-202ENST00000401498 WDR63Q8IWG1 891 aa39.23■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 IL16Q14005 1332 aa39.21■■■■□ 3.87
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF521Q96K83 1311 aa39.21■■■■□ 3.87
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PKDCC-202ENST00000401498 GNPATO15228 680 aa39.21■■■■□ 3.87
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