RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf167Q5SNV9 1468 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A3P48751 1232 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 GNAI1P63096 354 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM22Q9NS69 142 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 DLC1Q96QB1 1528 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC27Q2M243 656 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 TECPR2O15040 1411 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NF2P35240 595 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 OGFOD1Q8N543 542 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NEUROD6Q96NK8 337 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 RNF181Q9P0P0 153 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MED14O60244 1454 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SLC15A2Q16348 729 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CPS1P31327 1500 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 RIMBP2O15034 1052 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PTCH1Q13635 1447 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 RUNDC1Q96C34 613 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 FLT4P35916 1363 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 DIP2AQ14689 1571 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA1P04083 346 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 FGD1P98174 961 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 WDR78Q5VTH9 848 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PIM2Q9P1W9 311 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A1P11836 297 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ERFEQ4G0M1 354 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MTFR1LQ9H019 292 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 POLKQ9UBT6 870 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NSD2O96028 1365 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PDE6BP35913 854 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NIM1KQ8IY84 436 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CNKSR1Q969H4 720 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NYXQ9GZU5 481 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 H7C1D1 291 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 A1BGP04217 495 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PRKG1Q13976 671 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MYO1BO43795 1136 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A2P04920 1241 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 F8W031 263 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ERBB3P21860 1342 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 PPIP5K2O43314 1243 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 MYD88Q99836 296 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ATP7BP35670 1465 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JLW4 131 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL6Q8N841 843 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 VEZTQ9HBM0 779 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB2P05120 415 aa5.53□□□□□ -1.52
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