RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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USP21-201ENST00000289865 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
USP21-201ENST00000289865 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
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USP21-201ENST00000289865 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.77■■□□□ 1.4
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USP21-201ENST00000289865 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP21-201ENST00000289865 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP21-201ENST00000289865 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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USP21-201ENST00000289865 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.69■■□□□ 1.38
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USP21-201ENST00000289865 MX1P20591 662 aa23.66■■□□□ 1.38
USP21-201ENST00000289865 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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USP21-201ENST00000289865 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.64■■□□□ 1.38
USP21-201ENST00000289865 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.64■■□□□ 1.38
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USP21-201ENST00000289865 ANXA1P04083 346 aa23.64■■□□□ 1.37
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USP21-201ENST00000289865 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.62■■□□□ 1.37
USP21-201ENST00000289865 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.62■■□□□ 1.37
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USP21-201ENST00000289865 RILPL2Q969X0 211 aa23.59■■□□□ 1.37
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USP21-201ENST00000289865 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 ALS2Q96Q42 1657 aa23.57■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 SRGAP3O43295 1099 aa23.57■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 RAB11FIP3O75154 756 aa23.57■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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