RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 METTL24Q5JXM2 366 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SDSP20132 328 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SPATA32Q96LK8 384 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 HIP1O00291 1037 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TDO2P48775 406 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 C8orf34Q49A92 452 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 NECAB1Q8N987 351 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 RAI14Q9P0K7 980 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CEP89Q96ST8 783 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PANK2Q9BZ23 570 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 GOLIM4O00461 696 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 VAMP4O75379 141 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MNS1Q8NEH6 495 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CCDC192P0DO97 292 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 OLFM4Q6UX06 510 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 G2E3Q7L622 706 aa6.53□□□□□ -1.36
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LMO3-201ENST00000261169 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.53□□□□□ -1.36
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LMO3-201ENST00000261169 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ISM2Q6H9L7 571 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 COPS6Q7L5N1 327 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KIF14Q15058 1648 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ABCC11Q96J66 1382 aa6.52□□□□□ -1.36
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LMO3-201ENST00000261169 USP25Q9UHP3 1055 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KIAA0556O60303 1618 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 XBP1P17861 261 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HSPA2P54652 639 aa6.52□□□□□ -1.37
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LMO3-201ENST00000261169 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CEP170Q5SW79 1584 aa6.52□□□□□ -1.37
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LMO3-201ENST00000261169 NUCB1Q02818 461 aa6.52□□□□□ -1.37
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LMO3-201ENST00000261169 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 AIDAQ96BJ3 306 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CCDC69A6NI79 296 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 BIN1O00499 593 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 OFD1O75665 1012 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TPM2P07951 284 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PDE1AP54750 535 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TTC22Q5TAA0 569 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 EYA1Q99502 592 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 STARD3NLO95772 234 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD1Q15327 319 aa6.51□□□□□ -1.37
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