RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PIGBQ92521 554 aa25.55■■□□□ 1.68
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HOXD11-201ENST00000249504 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 MRC1P22897 1456 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 IL17REQ8NFR9 667 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 PLSCR1O15162 318 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 TEFQ10587 303 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 MCM10Q7L590 875 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.51■■□□□ 1.67
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HOXD11-201ENST00000249504 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD11-201ENST00000249504 WWC1Q8IX03 1113 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF521Q96K83 1311 aa25.5■■□□□ 1.67
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HOXD11-201ENST00000249504 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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HOXD11-201ENST00000249504 LY75O60449 1722 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXD11-201ENST00000249504 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD11-201ENST00000249504 TXNRD1Q16881 649 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD11-201ENST00000249504 ATG3Q9NT62 314 aa25.45■■□□□ 1.66
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HOXD11-201ENST00000249504 GNAI1P63096 354 aa25.32■■□□□ 1.64
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HOXD11-201ENST00000249504 KCNQ3O43525 872 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD11-201ENST00000249504 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD11-201ENST00000249504 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.31■■□□□ 1.64
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HOXD11-201ENST00000249504 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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HOXD11-201ENST00000249504 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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HOXD11-201ENST00000249504 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXD11-201ENST00000249504 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.27■■□□□ 1.64
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HOXD11-201ENST00000249504 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD11-201ENST00000249504 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 SLC15A2Q16348 729 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF827Q17R98 1081 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 AK7Q96M32 723 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 AKT1S1Q96B36 256 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.21■■□□□ 1.63
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