RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEFLP07196 543 aa12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 DCTN1Q14203 1278 aa12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 MCM10Q7L590 875 aa12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC125Q86Z20 511 aa12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 IL17REQ8NFR9 667 aa12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.02□□□□□ -0.48
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 APBA3O96018 575 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 RIPK4P57078 832 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEUROD2Q15784 382 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 PIGBQ92521 554 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 C5P01031 1676 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 TJP1Q07157 1748 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 BAG6P46379 1132 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 CABP4P57796 275 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 PALLDQ8WX93 1383 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 TEFQ10587 303 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLSCR1O15162 318 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATG3Q9NT62 314 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC39A6Q13433 755 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAMEF10-201ENST00000235347 C4BP0C0L5 1744 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 TXNRD1Q16881 649 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC27Q2M243 656 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 PROM2Q8N271 834 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 BTBD11A6QL63 1104 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNQ3O43525 872 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNQ4P56696 695 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 SIK1P57059 783 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF790Q6PG37 636 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 WWC1Q8IX03 1113 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ITPK1Q13572 414 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 NGEFQ8N5V2 710 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF521Q96K83 1311 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP6V1AP38606 617 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 CHL1O00533 1208 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF853P0CG23 659 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 CFAP44Q96MT7 982 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 IFT57Q9NWB7 429 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAMEF10-201ENST00000235347 C4AP0C0L4 1744 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 CASZ1Q86V15 1759 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 MBIPQ9NS73 344 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 IL16Q14005 1332 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 GNAI1P63096 354 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF827Q17R98 1081 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 WDR63Q8IWG1 891 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 AKT1S1Q96B36 256 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms