Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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