Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms