Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms