Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms