Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms