Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gpc6Q9R087 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc6Q9R087 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gpc6Q9R087 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc6Q9R087 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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