Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms