Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms