Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms