Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rapgef4Q9EQZ6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rapgef4Q9EQZ6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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