Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms