Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms