Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms