Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Usp12Q9D9M2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp12Q9D9M2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp12Q9D9M2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp12Q9D9M2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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